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segunda-feira, 2 de junho de 2025

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Esses peixes são os 'fósseis vivos' definitivos

Os genomas dos peixes são tão estáticos que grupos cujo último ancestral comum viveu na época dos dinossauros podem produzir híbridos férteis hoje

descendentes híbridos de um peixe-jacaré e um peixe-jacaré malhado
Este peixe é um híbrido descendente de um peixe-jacaré ( Atractosteus spatula ) e de um peixe-jacaré-pintado ( Lepisosteus oculatus ) — dois gêneros que compartilharam um ancestral comum pela última vez há pelo menos 100 milhões de anos. Solomon David
imagem da capa da edição
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Uma versão desta história apareceu na Science, Vol. 383, Edição 6687. Baixar PDF

Em 1859, Charles Darwin cunhou o termo "fóssil vivo" para descrever linhagens que se assemelham há dezenas de milhões de anos, como o celacanto, o esturjão e o caranguejo-ferradura. O termo cativou a imaginação popular, mas os cientistas têm lutado para entender se essas espécies apenas se assemelham a seus ancestrais longínquos ou se, de fato, evoluíram pouco ao longo das eras.

Agora, em um estudo publicado hoje na Evolution , pesquisadores confirmam que em alguns — mas não em todos — fósseis vivos, a evolução está praticamente estagnada . Os exemplos mais impressionantes são os peixes de aparência pré-histórica chamados gars, que apresentam a taxa de evolução molecular mais lenta entre todos os vertebrados com mandíbula. A equipe também propõe um mecanismo para explicar a atemporalidade dos gars: um excelente mecanismo de reparo de DNA. Esse reparo provavelmente manteve os genomas dos gars tão estáveis ​​que espécies e até mesmo gêneros cujo último ancestral comum viveu há mais de 100 milhões de anos divergiram muito pouco, e alguns ainda conseguem hibridizar hoje para produzir descendentes viáveis.

"Isso é incrível", diz Tetsuya Nakamura, biólogo evolucionista do desenvolvimento da Universidade Rutgers, que não participou do trabalho. "Este artigo traz muitos trabalhos interessantes sobre a questão do que constitui um fóssil vivo, mas quando li isso, fiquei chocado."

Para verificar se vários supostos fósseis vivos evoluem mais lentamente do que outros grupos de vertebrados, a equipe reuniu sequências publicadas de mais de 1.100 éxons (as regiões codificadoras do genoma) de 478 espécies. Utilizando árvores genealógicas existentes para cada grupo, eles criaram uma enorme árvore evolutiva. Para cada linhagem, os pesquisadores estimaram a taxa de mudança de cada base de DNA nos éxons estudados ao longo do tempo — a chamada taxa de substituição.

Surpreendentemente, eles descobriram que a evolução não estava em pausa em todos os fósseis vivos. O celacanto, o tubarão-elefante e uma ave chamada cigana — todos considerados antigos — apresentam taxas de mutação mais rápidas do que o esperado, de cerca de 0,0005 mutações em cada sítio por milhão de anos, embora ainda seja mais lenta do que a taxa média para anfíbios (0,007 mutações por milhão de anos) e mamíferos placentários (0,02 mutações por milhão de anos). As descobertas corroboram a ideia de que algumas espécies que ainda se assemelham a seus ancestrais antigos mudaram em nível molecular.

Mas os gars, grandes peixes de água doce com focinhos longos e dentados, eram diferentes: em quase todos os éxons, os gars apresentavam as taxas mais lentas de substituição molecular, muitas vezes em várias ordens de magnitude, e apresentavam uma média de apenas 0,00009 mutações por milhão de anos em cada sítio. De fato, dois gêneros que divergiram há cerca de 20 milhões de anos apresentaram sequências idênticas em quase todos os sítios analisados ​​— uma descoberta que a equipe inicialmente atribuiu a um erro de sequenciamento. "Entrei neste projeto com cautela ao usar o termo fóssil vivo", diz o coautor do estudo, Chase Brownstein, doutorando em biologia evolutiva na Universidade de Yale. "Mas, pelo menos para os gars, é um termo apropriado."

Os autores postulam que, como as taxas de substituição em gars parecem consistentemente baixas em todos os locais — inclusive em regiões genômicas com pouca probabilidade de estarem sob pressão seletiva —, é provável que haja um mecanismo global impulsionando a lenta substituição. Eles sugerem que os gars são extremamente eficientes no reparo do DNA após mutações ou danos, impedindo a evolução dos animais mesmo com a mudança dos continentes ao seu redor. Uma hipótese semelhante já foi proposta por outros pesquisadores para o esturjão, que apresentou a segunda menor taxa de substituição entre os vertebrados do estudo.

DNA repair is “a reasonable hypothesis, but there’s probably more than just one explanation,” says Elise Parey, an evolutionary genomicist at University College London. Experts have noted, for example, that gars have slow metabolic rates and long generation times, features that could reduce mutation rates. Gars have also preserved the arrangement of DNA in their chromosomes and dampened the effects of so-called jumping genes that can cause genetic reshuffling as they move from place to place in the genome. “This goes not just to sequence changes, but also to chromosome evolution, which would be an interesting avenue to explore,” Parey says.

Para testar suas descobertas, os autores acompanharam relatos de peixes-agulha incomuns que poderiam ser híbridos naturais em rios por todo Oklahoma e Texas. Eles analisaram amostras de tecido de dezenas desses peixes para rastrear sua ancestralidade, descobrindo que dois gêneros de peixes-agulha — Atractosteus e Lepisosteus — estão se cruzando para produzir filhotes férteis e híbridos. Esses grupos compartilharam um ancestral comum pela última vez há cerca de 105 milhões de anos, tornando sua separação a mais antiga entre eucariotos que podem produzir descendentes viáveis. Os peixes-agulha superaram os recordistas anteriores — duas espécies de samambaia — em cerca de 60 milhões de anos. (Mentes perspicazes podem se lembrar do peixe- esturddel , um híbrido de peixe-espátula e esturjão, que divergiu há ainda mais tempo, mas esses híbridos acidentais provavelmente eram estéreis e não ocorrem naturalmente.)

O próximo passo será comprovar que os mecanismos de reparo do DNA dos peixes-agulha são de fato responsáveis ​​pela ausência de alterações genéticas. Ao equipar o peixe-zebra — um modelo animal padrão — com genes de reparo do DNA dos peixes-agulha, os pesquisadores poderão observar os genes em ação em laboratório. "Este será um experimento desafiador, no entanto, porque [os genes de reparo do DNA] são fundamentais", e alterá-los pode ter consequências indesejadas, diz Nakamura.

Mas os autores afirmam que entender como os gars mantêm sua taxa de mutação tão baixa pode trazer benefícios que vão além da compreensão dos fósseis vivos em nível molecular. Também pode ajudar os humanos a entender melhor nossas próprias vias de reparo do DNA, que podem levar ao câncer quando falham.


doi: 10.1126/science.zersmjv

sexta-feira, 23 de maio de 2025

Translator

 

Esses peixes são os 'fósseis vivos' definitivos

Os genomas dos peixes são tão estáticos que grupos cujo último ancestral comum viveu na época dos dinossauros podem produzir híbridos férteis hoje

descendentes híbridos de um peixe-jacaré e um peixe-jacaré malhado
Este peixe é um híbrido descendente de um peixe-jacaré ( Atractosteus spatula ) e de um peixe-jacaré-pintado ( Lepisosteus oculatus ) — dois gêneros que compartilharam um ancestral comum pela última vez há pelo menos 100 milhões de anos. Solomon David
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Uma versão desta história apareceu na Science, Vol. 383, Edição 6687. Baixar PDF

Em 1859, Charles Darwin cunhou o termo "fóssil vivo" para descrever linhagens que se assemelham há dezenas de milhões de anos, como o celacanto, o esturjão e o caranguejo-ferradura. O termo cativou a imaginação popular, mas os cientistas têm lutado para entender se essas espécies apenas se assemelham a seus ancestrais longínquos ou se, de fato, evoluíram pouco ao longo das eras.

Agora, em um estudo publicado hoje na Evolution , pesquisadores confirmam que em alguns — mas não em todos — fósseis vivos, a evolução está praticamente estagnada . Os exemplos mais impressionantes são os peixes de aparência pré-histórica chamados gars, que apresentam a taxa de evolução molecular mais lenta entre todos os vertebrados com mandíbula. A equipe também propõe um mecanismo para explicar a atemporalidade dos gars: um excelente mecanismo de reparo de DNA. Esse reparo provavelmente manteve os genomas dos gars tão estáveis ​​que espécies e até mesmo gêneros cujo último ancestral comum viveu há mais de 100 milhões de anos divergiram muito pouco, e alguns ainda conseguem hibridizar hoje para produzir descendentes viáveis.

"Isso é incrível", diz Tetsuya Nakamura, biólogo evolucionista do desenvolvimento da Universidade Rutgers, que não participou do trabalho. "Este artigo traz muitos trabalhos interessantes sobre a questão do que constitui um fóssil vivo, mas quando li isso, fiquei chocado."

Para verificar se vários supostos fósseis vivos evoluem mais lentamente do que outros grupos de vertebrados, a equipe reuniu sequências publicadas de mais de 1.100 éxons (as regiões codificadoras do genoma) de 478 espécies. Utilizando árvores genealógicas existentes para cada grupo, eles criaram uma enorme árvore evolutiva. Para cada linhagem, os pesquisadores estimaram a taxa de mudança de cada base de DNA nos éxons estudados ao longo do tempo — a chamada taxa de substituição.

Surpreendentemente, eles descobriram que a evolução não estava em pausa em todos os fósseis vivos. O celacanto, o tubarão-elefante e uma ave chamada cigana — todos considerados antigos — apresentam taxas de mutação mais rápidas do que o esperado, de cerca de 0,0005 mutações em cada sítio por milhão de anos, embora ainda seja mais lenta do que a taxa média para anfíbios (0,007 mutações por milhão de anos) e mamíferos placentários (0,02 mutações por milhão de anos). As descobertas corroboram a ideia de que algumas espécies que ainda se assemelham a seus ancestrais antigos mudaram em nível molecular.

Mas os gars, grandes peixes de água doce com focinhos longos e dentados, eram diferentes: em quase todos os éxons, os gars apresentavam as taxas mais lentas de substituição molecular, muitas vezes em várias ordens de magnitude, e apresentavam uma média de apenas 0,00009 mutações por milhão de anos em cada sítio. De fato, dois gêneros que divergiram há cerca de 20 milhões de anos apresentaram sequências idênticas em quase todos os sítios analisados ​​— uma descoberta que a equipe inicialmente atribuiu a um erro de sequenciamento. "Entrei neste projeto com cautela ao usar o termo fóssil vivo", diz o coautor do estudo, Chase Brownstein, doutorando em biologia evolutiva na Universidade de Yale. "Mas, pelo menos para os gars, é um termo apropriado."

Os autores postulam que, como as taxas de substituição em gars parecem consistentemente baixas em todos os locais — inclusive em regiões genômicas com pouca probabilidade de estarem sob pressão seletiva —, é provável que haja um mecanismo global impulsionando a lenta substituição. Eles sugerem que os gars são extremamente eficientes no reparo do DNA após mutações ou danos, impedindo a evolução dos animais mesmo com a mudança dos continentes ao seu redor. Uma hipótese semelhante já foi proposta por outros pesquisadores para o esturjão, que apresentou a segunda menor taxa de substituição entre os vertebrados do estudo.

O reparo do DNA é "uma hipótese razoável, mas provavelmente há mais de uma explicação", afirma Elise Parey, genômica evolucionista da University College London. Especialistas notaram, por exemplo, que os gars têm taxas metabólicas lentas e longos tempos de geração , características que podem reduzir as taxas de mutação. Os gars também preservaram o arranjo do DNA em seus cromossomos e atenuaram os efeitos dos chamados genes saltadores, que podem causar rearranjos genéticos à medida que se movem de um lugar para outro no genoma. "Isso se aplica não apenas às mudanças de sequência, mas também à evolução cromossômica, o que seria um caminho interessante a ser explorado", afirma Parey.

Para testar suas descobertas, os autores acompanharam relatos de peixes-agulha incomuns que poderiam ser híbridos naturais em rios por todo Oklahoma e Texas. Eles analisaram amostras de tecido de dezenas desses peixes para rastrear sua ancestralidade, descobrindo que dois gêneros de peixes-agulha — Atractosteus e Lepisosteus — estão se cruzando para produzir filhotes férteis e híbridos. Esses grupos compartilharam um ancestral comum pela última vez há cerca de 105 milhões de anos, tornando sua separação a mais antiga entre eucariotos que podem produzir descendentes viáveis. Os peixes-agulha superaram os recordistas anteriores — duas espécies de samambaia — em cerca de 60 milhões de anos. (Mentes perspicazes podem se lembrar do peixe- esturddel , um híbrido de peixe-espátula e esturjão, que divergiu há ainda mais tempo, mas esses híbridos acidentais provavelmente eram estéreis e não ocorrem naturalmente.)

O próximo passo será comprovar que os mecanismos de reparo do DNA dos peixes-agulha são de fato responsáveis ​​pela ausência de alterações genéticas. Ao equipar o peixe-zebra — um modelo animal padrão — com genes de reparo do DNA dos peixes-agulha, os pesquisadores poderão observar os genes em ação em laboratório. "Este será um experimento desafiador, no entanto, porque [os genes de reparo do DNA] são fundamentais", e alterá-los pode ter consequências indesejadas, diz Nakamura.

Mas os autores afirmam que entender como os gars mantêm sua taxa de mutação tão baixa pode trazer benefícios que vão além da compreensão dos fósseis vivos em nível molecular. Também pode ajudar os humanos a entender melhor nossas próprias vias de reparo do DNA, que podem levar ao câncer quando falham.


doi: 10.1126/science.zersmjv

terça-feira, 9 de janeiro de 2024

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Fósseis vivos: 12 criaturas que parecem iguais a milhões de anos atrás

terça-feira, 22 de março de 2022


 

Ginkgoales : Registro Fóssil

Ginkgo tem um registro fóssil venerável

O gênero Ginkgo , representado hoje pelo amplamente cultivado chinês espécie Ginkgo biloba , tem uma linhagem evolutiva que remonta ao Jurássico Inferior , cerca de 190 milhões de anos atrás. Embora este gênero tenha sofreu muitas mudanças ao longo deste período de tempo, o material foliar fossilizado da espécie terciária Ginkgo adiantoides é considerado similar ou mesmo idêntico ao produzido pelas modernas Ginkgo biloba árvores

Os fósseis mais antigos vêm de um único local no que é hoje a Ásia parte da ex-URSS. Durante o Meio Jurássico houve um grande aumento de sítios de fósseis de ginkgo em todo o norte do Supercontinente Laurasiano. Pelo menos duas espécies existiam neste momento. A diversidade máxima foi atingida durante o Cretáceo com cinco ou seis espécies identificadas no Hemisfério Norte. Essas espécies são principalmente distinguíveis com base na anatomia foliar e distribuição geográfica.

tocos fósseis

Pelo Paleoceno , diversidade no gênero Ginkgo foi reduzida a um único espécies polimórficas, muitas vezes referidas como Ginkgo adiantoides , moderno Ginkgo biloba . Esta espécie foi distribuída principalmente nas regiões do norte devido ao ambiente tropical da época. Como o clima da Terra esfriou durante o Oligoceno , a espécie assumiu uma ao sul distribuição ocupado anteriormente. Além disso, o número de sítios fósseis diminui agudamente. Cerca de sete milhões de anos atrás, ele desapareceu de o registro fóssil da América do Norte.

Embora o Ginkgo adiantoides fosse particularmente abundante na Europa no início do Plioceno , desapareceu dessa região há cerca de 2,5 milhões de anos. Existem muito número limitado de fósseis encontrados desde o Plioceno, e para o Pleistoceno, nenhum fóssil de Ginkgo é conhecido. Os cientistas pensavam que o gênero foi extinto, no entanto, por meio de eventos misteriosos, Ginkgo biloba conseguiu sobreviver na China até os tempos modernos. Estes ginkgoes foram encontrados principalmente em mosteiros nas montanhas, onde eles foram cultivados por monges budistas. O ginkgo foi trazido essas montanhas por volta de 1100 d.C. e se espalharam rapidamente Ásia temperada. Foi plantado pela primeira vez na Europa no início de 1700 e em América mais tarde naquele século.

ginkgo fóssil


Outros fósseis Ginkgoalean

Os primeiros fósseis atribuídos aos Ginkgoales provêm do Permiano , embora alguns destes não pertençam claramente a este grupo. Ambos Trichopitys e Polyspermophyllum , do Permiano Inferior, têm folhas bifurcadas e apêndices curtos, bifurcados, portadores de óvulos que assemelham-se muito às características do Ginkgo . Ambos foram em comparação com outros grupos de plantas com sementes.

Tradicionalmente, os paleobotânicos reconheceram gêneros de ginkgo fósseis relacionados chamado Baiera e Ginkgoites . Mais recentemente, muitos os trabalhadores rejeitam esta classificação porque é mal definida. O única grande distinção entre Ginkgo e Baiera é que Ginkgo é usado para folhas com mais de quatro veias por segmento e Baiera para formas com menos de quatro nervuras por segmento. Outro gênero relacionado é Sphenobaiera , com uma folha amplamente em forma de cunha sem pecíolo distinto. Muitos cientistas acreditam que esses características estão dentro dos limites de variação intra-gênero, e portanto, inclua-os no Ginkgo também.

Muitas Ginkgo , incluindo Ginkgoites e Baiera , foram relatados de várias localidades e horizontes estratigráficos de mais jovem mesozóico idade no nordeste da China sob os nomes genéricos de Ginkgo , Baiera e Ginkgoites . é muito duvidoso se um número tão grande de espécies, 70, realmente existiu. A ocorrência fóssil Ginkgo , incluindo Ginkgoites e Baiera folhas é tão esporádica que ainda desconhecemos suas especificidades identificação e faixa de variação. Independentemente do número de espécies, no entanto, sabemos que os ginkgoes eram um grupo comum e difundido por um há muito tempo.



Fontes:
Del Tredici, P. 1989. Ginkgos e multituberculados: evolutivos interações no Terciário. BioSystems 21-22:327-337.

Macleod, SE e Hills, LV 1991. Planta Tithoniana a pré-Albiana macrofósseis. v.70-71:23-24.

Taylor, Thomas N. e Edith L., 1993, The Biology and Evolution of Fossil Plantas. Prentice Hall, Nova Jersey, pp. 636-43.

Zhao, L., et ai. 1993. Uma população fóssil de Ginkgo sai do Formação Xingyuan, Mongólia Interior. Transações e processos do Sociedade Paleontológica do Japão. Nº 169:73-96.