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Genomas antigos revelam mais de dois mil anos de estrutura populacional dingo
Editado
por Marcus Feldman, Universidade de Stanford, Stanford, CA; recebido em
17 de abril de 2024; aceito em 4 de junho de 2024
Significado
Os
dingos são um elemento icônico da biodiversidade da Austrália, mas a
gestão e a conservação dos dingos baseadas em evidências dependem da
compreensão de suas origens e história populacional. Neste estudo,
apresentamos dados genômicos de antigos indivíduos dingo, fornecendo uma
janela para a história inicial dos dingos na Austrália, antes da
introdução dos cães domésticos modernos e da perseguição dos dingos
pelos colonizadores europeus. Nossos resultados fornecem informações
sobre a ancestralidade e as origens das populações modernas de dingo,
incluindo sua relação com os cães cantores da Nova Guiné, e representam
um recurso valioso para desenvolvimentos futuros no manejo e conservação
do dingo.
Resumo
Os
dingos são canídeos de vida livre cultural e ecologicamente
importantes, cujos ancestrais chegaram à Austrália há mais de 3.000 AP,
provavelmente transportados por marinheiros. No entanto, a história
inicial dos dingos na Austrália – incluindo o número de populações
fundadoras e as suas rotas de introdução – permanece incerta. Esta
incerteza surge em parte da relação complexa e pouco compreendida entre
os dingos modernos e os cães cantores da Nova Guiné, e das suspeitas de
que a hibridização pós-colonial introduziu ancestrais recentes de cães
domésticos nos genomas de muitas populações de dingos selvagens. Neste
estudo, analisamos dados do genoma de nove espécimes antigos de dingo
com idades entre 400 e 2.746 anos, anteriores à introdução de cães
domésticos na Austrália pelos colonos europeus.
Descobrimos evidências
de que a estrutura populacional continental observada nas populações
dingo modernas já havia surgido há vários milhares de anos. Também
detectamos um excesso de compartilhamento de alelos entre cães cantores
da Nova Guiné e antigos dingos da costa de Nova Gales do Sul (NSW) em
comparação com antigos dingos do sul da Austrália, independentemente de
qualquer ancestralidade híbrida pós-colonial nos genomas de indivíduos
modernos.
Nossos resultados são consistentes com vários cenários
demográficos, incluindo um cenário em que a ancestralidade dos dingos da
costa leste da Austrália resulta de pelo menos duas ondas de migração
de populações de origem com afinidades variadas com cães cantores da
Nova Guiné. Também contribuímos para o crescente conjunto de evidências
de que os dingos modernos derivam pouca ancestralidade genômica da
hibridização pós-colonial com outras linhagens de cães domésticos,
descendendo principalmente de antigos canídeos introduzidos em Sahul há
milhares de anos.
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Data, Materials, and Software Availability
The DNA sequencing reads generated for this study have been deposited in the European Nucleotide Archive (ENA) (PRJEB75610) (95). Mitochondrial genome consensus sequences constructed from these data are available on GenBank (PP812314-PP812321 & PP812323-PP812333) (96). Genotype files and other supplementary data are available on Figshare (DOI: https://doi.org/10.25909/25885747) (97).
Acknowledgments
Reconhecemos
os guardiões tradicionais das terras das quais os espécimes utilizados
neste estudo foram coletados e prestamos nossos respeitos aos Anciãos,
do passado e do presente. Agradecimentos especiais a Clem Lawrie,
Custodiante Sênior de Mirning e Titular do Título Nativo por facilitar o
acesso aos espécimes de dingo da Caverna Koonalda. Reconhecemos também o
Conselho de Terras Locais de La Perouse e o Conselho de Terras
Aborígenes Locais Metropolitanos por concederem permissão para datar por
radiocarbono e analisar geneticamente espécimes de dingo de sítios
arqueológicos em NSW. Estendemos nosso sincero agradecimento às
seguintes pessoas por seus inestimáveis conselhos e assistência: Steve
Johnson, Shing Kwong, Raphael Eisenhofer, Steven Bourne, Jessie
Treloar, Mary-Anne Binnie, Michael Curry, Adara Curry, Brett Dalziel,
Alan Treloar, Isabella Donato , Michael Westaway, Christian Huber,
Pontus Skoglund e Anders Bergström. O ARCHE da Griffith University e o
ACAD da University of Adelaide forneceram acesso a antigos laboratórios
de DNA. Estendemos nossa gratidão à equipe do Museu Australiano –
incluindo Val Attenbrow, Allison Dejanovic, Niamh Formosa, Dale
Higginson, Rebecca Jones e Mariko Smith – por conceder acesso às
coleções e autorizações de estudo no museu. Agradecemos ao South
Australian Museum, ao QLD Museum e ao Western Australian Museum por
concederem acesso aos espécimes em suas coleções. Agradecemos ao QLD
Parks and Wildlife Service e ao Departamento de Meio Ambiente e Ciência
(QLD) por fornecer acesso aos espécimes de dingo K'gari, e aos Parques
Nacionais e Vida Selvagem do Sul da Austrália pela assistência com
logística de campo e licenciamento. Somos gratos aos membros da
Federação Espeleológica Australiana – incluindo Nicholas White, Susan
White, Margaret James, Daryl Carr, Denis Marsh, Greg Leeder, Ian Curtis e
Steve Milner – que coordenaram e conduziram o trabalho de campo em
Nullarbor. Além disso, agradecemos ao AGRF, ao Instituto Garvan de
Pesquisa Médica, à Macrogen e à Novogene Bioinformatics Technology
Corporation Limited por fornecer serviços de sequenciamento de DNA de
alto rendimento. Finalmente, estendemos nossa gratidão a dois revisores
anônimos, cujos comentários melhoraram este manuscrito. Este trabalho
foi apoiado pelo Fundo de Alavancagem Estratégica do Environmental
Futures Research Institute, Griffith University; o Centro de Excelência
do Conselho Australiano de Pesquisa para a Biodiversidade e Patrimônio
Australiano (ARC CE170100015); uma bolsa Laureate do Australian Research
Council (ARC FL140100260); e um prêmio do Australian Research Council
Discovery Project (DP210101960). ER reconhece o apoio ao trabalho de
campo de Nullarbor e à datação por radiocarbono de uma bolsa Barbara
Kidman e financiamento do Instituto Ambiental da Universidade de
Adelaide.
Contribuições do autor
YS,
SW, GC, BL, JLW, SO, AC e KJM projetaram pesquisas; YS e SW realizaram
pesquisas; GC, SO, MA, JWOB, ER, LK, KW, JLW, JB, S.O'C. e AC forneceram
recursos (amostras); SW, PB, HH, JLW e KJM realizaram trabalhos
laboratoriais de DNA; YS, SW, MPW, IB, JD, RT e KJM analisaram dados; e
YS, SW, MPW, GC, PB, HH, MA, JWOB, ER, LK, KW, JLW, JB, S.O'C., AC e KJM
escreveram o artigo.
Interesses conflitantes
Os autores declaram não haver interesses conflitantes.
Supporting Information
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