terça-feira, 11 de setembro de 2018

Comparing genetic diversity and demographic history in co-distributed wild South American camelids

Heredityvolume 121pages387400 (2018) | Download Citation

Abstract

Vicunhas e guanacos são duas espécies de camelídeos sul-americanos selvagens que são os principais ruminantes nos ecossistemas onde ocorrem. Embora intimamente relacionadas, estas espécies apresentam diferentes ecologias e personagens da história de vida, que devem influenciar tanto a sua diversidade genética e diferenciação da população em diferentes escalas espaciais. 

Aqui, utilizando marcadores genéticos mitocondriais e microssatélites, mostramos que as vicunhas apresentam menor diversidade genética dentro das populações do que o guanaco, mas exibem mais estrutura em toda a sua faixa peruana, o que pode refletir uma combinação de diferenciação genética natural ligada ao isolamento geográfico e declínios populacionais antropogênicos recentes.. 

Análises demográficas baseadas em coalescentes indicam que ambas as espécies passaram por um forte gargalo, reduzindo seu tamanho efetivo de população de mais de 20.000 para menos de 1.000 indivíduos. Para vicunha, esse gargalo é inferido como ocorrido há 3300 anos, mas ocorreu mais recentemente para o guanaco há cerca de 2000 anos. 

Estas datas inferidas são consideravelmente mais tardias do que o início da domesticação (quando a alpaca foi domesticada da vicunha enquanto a lhama foi domesticada do guanaco), coincidindo em vez disso com uma grande expansão da população humana após o período frio do Holoceno médio.

Tão importante, implicam declínios anteriores quanto a bem documentada conquista espanhola, onde grandes eventos de mortalidade em massa foram registrados para populações humanas e camelídeos andinos. Argumentamos que as diferenças subjacentes das espécies e as recentes perturbações demográficas influenciaram a diversidade genética nas populações modernas de vicunha e guanaco, e esses processos devem ser cuidadosamente avaliados no desenvolvimento e implementação de estratégias de manejo para esses importantes recursos genéticos.

    References

    1. Aldenderfer M (1999) The Pleistocene/Holocene transition in Peru and its effects upon human use of the landscape. Quat Int 53–54:11–19
  1. Ammann C, Jenny B, Kammer K, Messerli B (2001) Late quaternary glacier response to humidity changes in the arid Andes of Chile (18–29°S). Palaeogeogr Palaeoclimatol Palaeoecol 172:313–326
  2. Anello M, Daverio MS, Romero SR, Rigalt F, Silbestro MB, Vidal-Rioja L et al (2016) Genetic diversity and conservation status of managed vicuna (Vicugna vicugna) populations in Argentina. Genetica 144(1):85–97
  3. Baldi R, Acebedes P, Cuéllar E, Funes M, Hoces D, Puig S et al (2016) Lama guanicoe. The IUCN Red List of Threatened Species. e.T11186A18540211.ISSN 2307-8235
  4. Barnosky A, Lindsey E (2010) Timing of Quaternary megafaunal extinction in South America in relation to human arrival and climate change. Quat Int 217:10–29
  5. Belkhir K, Borsa P, Chikhi L, Raufaste N, Bonhomme F (1996) Laboratoire génome, populations, interactions, CNRS UMR 5000. Université de Montpellier II, Montpellier, 2004
  6. Benjamin Y, Yekutieli D (2001) The control of the false discovery rate in multiple testing under dependency. Ann Stat 29:1165–1188
  7. Brack A (1980) Conservación de la vicuña en el Peru. Fondo Editorial del Ministerio de Agricultura y Alimentacion, Lima, (Peru), 33pp.
  8. Bruford M, Hanotte O, Burke T (1998) Multi- and single locus DNA fingerprinting. IRL Press, Oxford
  9. Bustamante A, Zambelli A, De Lamo D, von Thungen J, Vidal-Rioja A (2002) Genetic variability of guanaco and llama populations in Argentina. Small Rumin Res 47:97–101
  10. Chikhi L, Sousa VC, Luisi P, Goossens B, Beaumont MA (2010) The confounding effects of population structure, genetic diversity and the sampling scheme on the detection and quantification of population size changes. Genetics 186(3):983–995
  11. Clement M, Posada D, Crandall KA (2000) TCS: a computer program to estimate gene genealogies. Mol Ecol 9(10):1657–1659
  12. Dieringer D, Schlötterer C (2003) Microsatellite analyser (MSA): a platform independent analysis tool for large microsatellite data sets. Mol Ecol Notes 3:167–169
  13. Dillehay TD (2009) Probing deeper into first American studies. Proc Natl Acad Sci USA 106(4):971–978
  14. Dodd C, Rodriguez J, Hoces D, Rosadio R, Wheeler J, Bruford M (2006) Genetic diversity and management implications for vicuña populations in Peru. In: Gerkin M, Renieri C (eds) South American Camelid Research, Vol 1. Wageningen Academic Publishers, Wageningen, p 87–96
  15. Evanno G, Regnaut S, Goudet J (2005) Detecting the number of clusters of individuals using the software STRUCTURE: a simulation study. Mol Ecol 14(8):2611–2620
  16. Excoffier L, Lischer HE (2010) Arlequin suite ver 3.5: a new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows. Mol Ecol Resour 10(3):564–567
  17. Frankin W (1983) Contrasting socioecologies of South America’s wild camelids: the vicuña and the guanaco. In: Eisenberg J, Kleiman D (eds) Advances in the study of animal behaviour, American Society of Mammalogists, Allen Press, Lawrence, Kansas, USA. pp 573–629.
  18. Goldberg A, Mychajliw AM, Hadly EA (2016) Post-invasion demography of prehistoric humans in South America. Nature 532(7598):232–235
  19. Gonzalez BA, Orozco-Terwengel P, von Borries R, Johnson WE, Franklin WL, Marín JC (2014) Maintenance of genetic diversity in an introduced island population of guanacos after seven decades and two severe demographic bottlenecks: implications for camelid conservation. PLoS ONE 9(3):e91714
  20. Goossens B, Chikhi L, Jalil MF, Ancrenaz M, Lackman-Ancrenaz I, Mohamed M et al. (2005) Patterns of genetic diversity and migration in increasingly fragmented and declining orang-utan (Pongo pygmaeus) populations from Sabah, Malaysia. Mol Ecol 14(2):441–456
  21. Grimwood I (1969) Notes on the distribution and status of some Peruvian mammals. American Committee for Wildlife Protection. Zoological Society Special Publication, New York, Vol 21

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